在火影忍者中我们知道，一开始的大蛇丸是火影中最大的反派，他是“木叶三忍”之一，和自来也，纲手是一个班的学生，也是战时的伙伴。大蛇丸为了能够研究出长生不老的秘诀，偷偷翻阅禁术，并且做一些惨不忍睹的实验。后来被三代火影亲自带领抓了个正着，大蛇丸也因此背叛木叶，逃往村外。

大蛇丸叛离木叶之后加入了晓组织，并且在晓组织里呆了一段时间，和当时的蝎组队。而一段时间过后，木叶村发生了一场重大的变故，那就是宇智波一族被灭满门。而当时灭其满门的就是自己的族人宇智波鼬，之后宇智波鼬逃离了村子，加入了晓组织。

这个事情在后期的故事中我们也是直到，当时木叶高村已经知道宇智波一族要发生叛乱，为了能够防止木叶村发生重大的变故，木叶村高层安排了宇智波鼬执行这次任务，并且借机潜入当时的晓组织，成为了木叶村的卧底。

在鼬加入晓组织之后，很快大蛇丸就打上了宇智波鼬的注意，想将他的写轮眼和身体占为己有。于是在一次偶然的机会，大蛇丸偷偷跟在宇智波鼬的身后，突然将右手幻化出蛇，并把鼬困住。本以为鼬的写轮眼就此可以拿到手，结果反倒被鼬的幻术困住不能动弹，手臂也被砍掉。

宇智波鼬没有和他计较，最终放了大蛇丸，而大蛇丸本来在晓组织混的不好，还和其他人有些矛盾，又因为这件事情，他从此对宇智波鼬产生了忌惮，于是在鼬加入晓组织不久，大蛇丸就逃离了晓组织。后面大蛇丸偷袭木叶村，被封印了双手。

为了占据宇智波佐助的身体，将佐助诱惑过来，每当自己手臂的封印发作，大蛇丸都会回忆起被宇智波鼬虐的场景，结果后来不仅身体没占据还被佐助给杀了。但是这个只是大蛇丸的一个分身，在佐助和有的对决中，大蛇丸又企图出来搞事情，结果又被鼬的十拳剑封印。自此大蛇丸暂时的领了盒饭，一直到第四次忍界大战中才复活过来。

虽然如今的蛇叔洗白了，从此不问世事，一直潜心搞自己的科学研究。但是宇智波鼬在他的心里埋下的阴影怕是一辈子都不会忘记。