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为了在实践中执行ISM，给定一个长度为L的输入DNA序列X，选择输入序列中的每个索引（核苷酸），并且对于三个替代核苷酸中的每一个，只更改第i个位置中的条目即可生成新序列。模型对替代序列和原始序列的预测之间的差异通常称为归因得分。对所有核苷酸重复**会产生一个称为属性图的4×L矩阵，它可以显示为序列标志（图3a）。与其他基于归因的方法相比，该******的结果。

4.基因组的重复序列少而短：原核生物基因组存在一定数量的重复序列，但比真核生物少得多，重复序列一般为******，重复程度十多次、上千次不等。

为了导航序列空间，通常应用称为定向进化的迭代搜索过程，其中生成成批的随机序列并筛选感兴趣的功能或属性。然后将最佳序列转移到下一轮文库生成和选择。实际上，这相当于使用「爬山」方法搜索序列空间，因此容易受到可能掩盖更好序列发现的局部最大值的影响。蛋白质设计的其他方法包括基于结构的设计，其中理想的结构是先验选择的，任务是使序列适合设计。

该模型迅速生成了100万个序列。研究团队根据它们与天然蛋白质序列的相似程度，以及AI蛋白质的潜在氨基酸“语法”和“语义”的自然程度，选择了100个序列进行测试。

行为识别是识别时间序列数据中的行为或动作的任务。RNN可以通过学习时间序列数据的序列信息，对不同的行为或动作进行识别。具体地，可以将时间序列数据作为输入序列，通过训练RNN模型，使得模型能够对不同的行为或动作进行分类。

词典排序:序列是逐个元素比较的。第一对不同的对应元素决定了序列的顺序。如果序列的长度不同，而且短序列和长序列的初始元素序列匹配，那么短序列小于长序列。长度相同而且对应元素都相等的两个序列是相等的。空序列总是小于非空序列。